1 ... 38 39 40 41 42 43 44 45 ... 74

The platon crystallographic package - səhifə 42

səhifə42/74
tarix04.12.2017
ölçüsü5.01 Kb.

1.4.20.6 - RoundCell


Round cell on 1,2,3 or 4 decimals before cell reduction.

1.4.20.24


1.4.20.25 - End 


1.4.21 – POWDER -Sub-Menu #0


1.4.21.1 - Ag Mo Cu X


By default, the powder pattern is simulated for the wavelength specified on input or, when 
absent, set to CuKa radiation.. 
The wavelength can be changed by clicking on the proper button. 
The 'X' box has two functions: 
1. To represent non-Cu,Mo,Ag input wavelength. 
2. Clicking on 'X' will reintroduce the input wavelength. 

1.4.21.2 - Lambda


Option to enter the wavelength to be used via the keyboard...

1.4.21.3 - VertScale


Vertical Scale Blow-up function to see weaker details. The click position determines the 
scale.

1.4.21.4 – HorsScale - TwoThetaMax


Maximum resolution of the powder pattern in 2-Theta. Clickable values are: 20, 40, 60, 80 
and 180 degrees. The default is 40 degrees in 2-Theta for Cu and 20 degrees for Ag and Mo.

1.4.21.5 - StepSize


By default, the simulated powder pattern is sampled at 0.02 Degree in 2-Theta. Alternative 
selections are 0.01, 0.02, 0.03, 0.04 & 0.05 Degree. 

1.4.21.6 - LineWidth


Parameter determining the linewidth of the reflection  represented by the Lorentzian 
function. L(x) = Intensity / (1 + A * x**2). Click values for A are 100.0, 10.0, 1.0, 0.1, 0.01.

 

1.4.21.19 - ListRefl


A reflection list sorted on theta up to TwoThetaMax of the powder pattern display. 
Keyboard instruction: 

LIST twotheta

 

1.4.21.21 - Displ-d-value


Display d-values toggle. This option plots d-values for strong enough powder lines.

1.4.21.22 - Displ-Theta-value


Display Theta-values toggle. This option provides for the display of theta values for strong 
enough reflections. 

1.4.21.23 - Decoration Toggle


Option to omit the info displayed on the outline of the display.

1.4.21.24 - EPS-File


Create hardcopy of the display output in PostScript format.

1.4.21.25 - END


Terminate this tool.

1.4.22 – CONTOUR SUB-MENU #0


1.4.22.1 – Options Sub-menu


1.4.22.2 - Fobs MAP


Selection of Contoured Fourier map (RED). 

1.4.22.3 - 2Fo-Fc MAP


Selection of Contoured Special (i.e. with coefficients 2Fo-Fc) Fourier map (RED). 

1.4.22.4 - Fo-Fc MAP


Contouring of difference Fourier map selected (RED).
 

1.4.22.5 - SQUEEZE MAP


Contouring of a SQUEEZE Fourier map. This option features a special difference Fourier 
map where F(obs) is assigned a phase corresponding to F(calc) based on both the 

contributions of the ordered part of the model and the disordered part (as obtained by back-
Fourier transformation of the density found in the disorder region) of the structure. F(calc) 
consists of the contribution of the ordered part of the structure. 
A SQUEEZE map should provide a clearer image of the density in a disorder region than 
obtainable with a standard difference map where Fobs is assigned the phase of Fcalc. 
A prior SQUEEZE calculation, providing the relevant information on '.hkp' is required for 
this option. 

1.4.22.6 - PLANE-TNCP


Fourier section plane is defined by three points (Either by Label or with fractional 
coordinates): 
1. Point defining x-axis (Default = [1 0 0]) 
2. Origin (Default = [0 0 0]) 
3. Third Point in Plane (Default = [0 1 0]) 
The three atoms can be defined either by clicking on atoms in the ORTEP figure or by 
typing the atom name in the interactive input window. 
Atoms that should be left out from the structure factor calculation can be indicated by 
clicking as well (click om OMITfromSFC) 

1.4.22.7 - PLANE-ABCD


With this option the Fourier section can be defined with the specification of the 4 constants a,b,c,d 
that define the plane in ax + by + cz = d. Two other pieces of information are needed to define the 
rotation about the plane normal. 

1.4.22.8 - PLANE-BISECT


Section planes defined by .. 

1.4.22.9 - PLANE PERP


Section plane defined by . 

1.4.22.10 - DIFF MAP XY,XZ,YZ Sections


Contouring of difference Fourier map with sections parallel to XY, XZ or YZ respectively. 

1.4.22.11 - PLANE-DIS-TOL


Atoms sites within a tolerance (Default = 1.5 Angstrom) are shown with a cross in the 
coutoured map. Atom site crossed are given in white when they are within the stepsize 
(default = 0.3 Angstrom) from the plane and blue otherwise. 

1.4.22.12 - VertAngSize



This button allows for the setting of the angstrom size of the Fourier section in the vertical 
(y) direction. The size in the horizontal direction is scaled accordingly. 

1.4.22.13 - HORS SHIFT


This feature allows for moving the display window over the contour map in the horizontal 
direction. Clicking in one or the three right boxes moves the window to the right (and the 
contents to the left) with smaller to larger step size) Clicking in one or the three left boxes 
moves the window to the left (and the contents to the right) with smaller to larger step size).
  

1.4.22.14 - VERT SHIFT


This feature allows for moving the display window over the contour map in the vertical 
direction. Clicking in one or the three right boxes moves the window in the upward 
direction (and the contents downwards) with smaller to larger step size) Clicking in one or 
the three left boxes moves the window in the downward direction (and the contents upwards
) with smaller to larger step size).

1.4.22.15 - Z-ROTATION


This feature allows for rotating the contour map about an axis perpendicular to the drawing. 
Rotations: 

-90, -60, -30, 30, 60, 90.

 Clicking in one or the three right boxes moves the map 
contents clockwise around the origin, with smaller to larger step size. Clicking in one or the 
three left boxes moves the map contents anti-clockwise around the origin, with smaller to 
larger step size. Keyboard instruction: 

ZROT angle

 

1.4.22.16 - SHOW BONDS Toggle


B
onds between atoms close to the contoured map plane can be shown on the map. 
This feature may be toggled on/off by clicking in this box. 

1.4.22.17 - LABEL ATOMS Toggle


Atoms within a certain distance range from the contoured map level are optionally labelled. 
The label toggle implements this option. 

1.4.22.18 - SECTION STEP SIZE


The section step size (Default 0.3 Angstrom)is shown above the contoured map. The step 
size may be set to another value by position sensitive clicking in the menu box. 

1.4.22.19 - CHANGE CONTOUR LEVEL


The current contour level step is shown above the contoured map, next to the map-type. The 
contour level step size (e/Ang**3) can be changed by clicking in the click position sensitive 

:

afs
afs -> Meningoensefalit, meningoensefalit
afs -> Nb deze bovenstaande tekst wel weghalen!
afs -> Allergen Checklist for Food Suppliers or Manufacturers


Dostları ilə paylaş:

©2018 Учебные документы
Рады что Вы стали частью нашего образовательного сообщества.
?


the-schools-white-paper---210.html

the-schools-white-paper---215.html

the-schools-white-paper---23.html

the-schools-white-paper---28.html

the-schools-white-paper---32.html